او فرزند سوم کنت ژان دو سنت‌اگزوپری بازرس بیمه در جنوب فرانسه و ماری دو فونسکلومب، اشراف‌زاده‌ای فرانسوی، بود. چهار سال بیشتر نداشت که پدرش مُرد و مادرش به تنهایی نگهداری و تربیت او را به عهده گرفت. دوران کودکی او با برادر و دو خواهرش در سن‌موریس و مول که املاک مادربزرگش در آنجا بود سپری شد و دوره‌ی دبستان را در مان به پایان رسانید. در ۱۹۱۴ برای ادامه تحصیل به سوئیس رفت. آنتوان در دوران تحصیل در دبستان و دانشکده گاهی ذوق و قریحه‌ی شاعری و نویسندگی خود را با نگاشتن و سرودن می‌آزمود و اغلب نیز مورد تشویق و تقدیر دبیران و استادانش قرار می‌گرفت. در سال ۱۹۱۷ تنها برادرش فرانسوا با ابتلا به بیماری روماتیسم قلبی درگذشت و بار مسئولیّت خانواده یکباره به گردن او افتاد. بعد از اخذ مدرک دیپلم وارد نیروی هوایی شد و پروازهای بسیاری به اکثر نقاط جهان انجام داد. در ۳۱ ژوئیه سال ۱۹۴۴ پرواز کرد و پس از آن هرگز دیده نشد.